看到魏大中這般斬金截鐵的回答，朱由校不由大喜，他就需要魏大中這種不畏權貴之人，於是當即囑咐道：

    “好，好的很，魏大中，朕沒有看錯你。朕命你為欽差大臣，攜王命旗牌前往河南，清查藩王不福王強買強買一事，不可冤枉一個好人，也絕不可冤枉一個壞人。”

    （以下為大綱式結尾）

    魏大中等人當即領命而去，隨後盧象升入乾清宮覲見，朱由校鑒於他的功勞，當即任命他為順天府府尹，張國維為天津府府丞。

    天啟四年十月，孫元化率使團返回大明，並成功帶來了伽利略等人。朱由校見狀派使者迎接，並於紫禁城親自接見伽利略，隨後任命他在國子監教授，主要教授西學，並且把京師同文館並入國子監，讓伽利略統領其事。

    天啟四年十二月，從美洲探險船隻返回，再加上孫元化使團、顏思齊在日本等事，大明出海之風大勝。

    天啟五年三月，顏思齊第一次打退九州藩主兵力合圍。

    天啟五年六月，顏思齊第二次打退兵力合圍，但此時江戶幕府已集結重兵，準備討伐顏思齊，而嶽等人就在其中，為日本效命。顏思齊遂向大明求援。

    天啟五年八月，朱由校商議，從遼東、海西營選拔女真罪兵，前往日本，受雇於顏思齊抵抗日本幕府。隨後日本幕府進攻薩摩藩，顏思齊據城而守，戰況激烈，就在危急關頭南直隸水師出現在鹿兒島水麵，炮擊幕府兵馬，江戶幕府大駭，被迫與顏思齊簽訂盟約。

    天啟五年十月，女真罪兵抵達鹿兒島。

    天啟六年三月，魏大中查清福王府人殺人、放貸、強買強賣等事，朱由校聞之大怒，剝奪福王三萬田土，以及種種特權，福王被迫自陳其罪。

    天啟六年五月，公開宗室條例，加強宗室考核、放鬆底層宗室限製，廢除世襲罔替。

    天啟七年，顏思齊進攻九州藩，第一次九州大戰開啟。同年，朱由校全力備荒，但有餘之前準備充分，雖有饑荒但沒有發生曆史上那般起義。

    天啟八年，顏思齊攻下肥後藩，江湖幕府再次討伐，第二次九州大戰開啟。朱由校加快運輸移民，向顏思齊提供人力。

    天啟九年，陝北連年大旱，發生零星起義，朱由校命洪承疇為陝西巡撫，盧象升為陝西三邊總督，總領其事，鼓勵西北移民東北、日本、台灣。

    天啟十年——十二年，起義此起彼伏，但均被鎮壓。但這也無形中加快流民遷移的步伐。顏思齊在九州連年征戰，統一九州，導致日本九州民不聊生，但越來越多的明人至此，讓其的壓力更大。

    天啟十五年，顏思齊病死，九州大亂，幕府再次進攻九州，顏思齊手下兄弟紛紛自立，最後有人邀請朝廷大軍進駐九州，於是朱由校派遣進去。

    天啟十八年，西北連年大旱，寸草不生，起義不斷。朱由校一邊鎮壓，一邊移民，一邊糾集，讓其封鎖在陝西境內，沒有益處。