寒門和世家的敵對勢力都被清除，接下來，當然是要對付皇家勢力了。司馬家族，大多是無能之輩，不足為慮，但是司馬休之，頗有才幹，是皇家中的翹楚。劉裕父子的大肆殺戮，自然引起皇家的警覺，司馬休之也就成了皇家對抗劉裕父子的最後一張底牌。

    司馬休之雖然為人低調老成，沒什野心，但為了維護皇家的安危，他也不得不奮力一博了。

    幾個月後，劉義隆帶領著朱齡石，在尋陽城和司馬休之展開決戰。司馬休之有治理之才，但卻不善用兵，根本就不是劉義隆他們的敵手。劉義隆輕而易舉地擊敗了司馬休之。司馬休之的手下，拚死護著他，讓他逃走。

    司馬休之逃到了尋陽江麵，想要登船而走。劉義隆緊追而至。劉義隆命弓箭手布開陣勢，射殺司馬休之。但成百上千的百姓迤邐而來，他們大多是老弱病殘，他們跪在中間，聲淚俱下地懇求放過他們的刺史。但他已不再是當年的劉義隆，懇求的百姓越多，他就越要殺了司馬休之。劉義隆不顧百姓，下令放箭，百姓擋在中間，紛紛中箭而亡。司馬休之心痛難忍，他想要棄船投降，隻求劉義隆能放過百姓。但司馬休之的手下死死攔住他，將他推到船上。箭枝射向司馬休之，他的手下就用身軀去擋。司馬休之被護在麵，悲痛欲絕。就在船要行走時，劉義隆拉開弓箭，對準司馬休之的額頭。朱齡石趕緊喊道:“使君，我來！”說罷，一箭射去，卻隻中他肩頭。劉義隆再想射擊，但司馬休之已被人扶進了船艙。劉義隆登船追擊，卻為時已晚。

    劉義隆惱恨地看向朱齡石，朱齡石跪地請罪。

    劉裕父子爭權奪利，塗炭百姓，致使幾萬士卒命喪疆場。沈林子對劉裕深感失望，他辭官隱退，歸隱山林。朱齡石稱病在家，再不想參與他們的殺伐。其他的大臣敢怒不敢言。

    朱齡石稱病在家，檀道濟來看望他。

    “伯君，好好的怎就病了？”

    “我也不知道，總是覺得忽冷忽熱，渾身提不起勁。”

    “伯君，你這是心病吧！”

    朱齡石沉默了一會兒，說道:“從前我們歸順於他們，就是希望他們能領著我們，行軍北伐，收複北方。可是現在看來，我們已經淪為他們爭權奪利的工具了。”

    “伯君，說實話，不管大將軍做了什，我始終相信他。晉國上下，官員們都安於享樂，隻有大將軍心懷抱負，想要一統河山。也隻有他有這個能力，帶領我們這些將士，收複北方。”

    “我也知道他有這個能力和抱負，隻是我擔心，大將軍被權勢所蒙蔽，漸漸地，忘了自己的初心。”

    檀道濟聽了，也深感憂慮。