一艘斯庫魯人的太空船墜落在紐約，當伊米爾領導的終極守望者和鋼鐵俠領導的神力複仇者趕到時，鋼鐵俠率先打開了艙門。令所有人大吃一驚的是，從太空船中走出來的竟是一些看上去即為陌生的超級英雄。站在他們麵前的超人、蝙蝠俠、閃電俠、綠箭俠、綠燈俠，自稱是從另外一個宇宙維度來臨，並且剛剛從斯庫魯人的手搶下了這艘太空船來到地球。

    另一方麵，正當漫威超級英雄們麵麵相覷的時候，潛伏在人間的墨菲斯托和希爾司令官串聯一氣開始發難。邪神洛基從阿斯加德回歸，摧毀了劍的太空站——尖峰塔，塔上的特工死傷無數。

    征服者康來到當前時空，趁機攻破了複仇者大廈，向鋼鐵俠全球控製中心的主機注入未來病毒，導致鋼鐵俠護甲完全損毀，全球所有和斯塔克工業公司聯網的單位——包括神盾指揮船——全部癱瘓。現在，一支龐大的未來征服者艦隊正在接近地球，入侵剛剛開始。

    短暫的僵持後，互相並不認可對方存在的兩隊超級英雄大打出手，來自於不同世界的英雄，仰望同一片空，危機，即將來臨！

    在紐約的街頭，一眾普通人正在圍攻一個無辜的變種人（主角最初的女朋友），閃電俠表示別怕，我先把你帶走。但是突然身體一震，他發現自己在這個世界中完全感覺不到神速力了。（某些東西在融合宇宙是沒用或者沒有的，比如閃電俠力量的來源——神速力，無限手套。綠燈充電池。氪石等等）

    另一方麵。征服者康出現在伊米爾的麵前，試圖抹消掉他這個不應該存在於這個世界的不安定因素。伊米爾匯合終極守望者眾人之力，擊退了征服者康的襲擊，但是征服者康並沒有打算就此認輸，在紐約，一支龐大的征服者艦隊已經抵達，成千上萬的征服者飛船如同潮水般湧出，開始征服這個時空中的主地球。

    就在兩隊超級英雄戰鬥的同時。斯庫魯人，一些擁有著變形能力的外星人，開始了對地球的入侵。數千名斯庫魯超能力展示降落在曼哈頓，全麵地麵入侵開始。少年複仇者和英雄獵手很快就被他們擊潰，斯庫魯人開始在麵向全世界的鏡頭前處死反抗的英雄，試圖殺一儆百。

    然而，尼克弗瑞率領的咆哮突擊隊的出現，為慘烈的戰局帶來了轉機。回到紐約，希爾司令官找到了被癱瘓了盔甲的托尼斯塔克，亮明了自己的身份。原來她是早已就潛伏在了地球上的斯庫魯女皇。她告訴斯塔克。其實真正在和他們決戰的並不是d英雄，而是由斯庫魯帝國的特工們所變化而成的“贗品”

    在這之後。希爾司令官人間蒸發了，但在她時之前，她癱瘓了地球上的所有防備係統，並且告訴其他人，他們眼前的托尼斯塔克並非本人，而是斯庫魯帝國有史以來最偉大的沉睡特工。

    一時間，地球似乎已經淪為了征服者康、斯庫魯人還有邪神洛基與德庫拉的殖民地。盡管超級英雄們陷入了苦戰，這場和意料之外敵人的戰鬥讓英雄們的身心都遭到了重創，他們甚至還不能確定到底有多少土地收到了斯庫魯人的見他，也不能確定身邊的朋友到底還有多少是斯庫魯特工。

    另一方麵，陷入身份危機的不僅僅是地球上的英雄們，在發現自己的真實身份其實是斯庫魯沉睡特工後，蝙蝠俠，曾經高傲的d超級英雄，高談市的守護者，在與康斯坦丁的一番對話後，憤然調轉矛頭進攻向了斯庫魯人的艦隊。

    與蝙蝠俠一同反叛了自己陣營的還有康斯坦丁、超人等等著名英雄。著猝不及防的一舉讓被捕捉的神奇先生，以及主動投靠向了斯庫魯人的毀滅博士，成功地掏出了斯庫魯人的控製。鋼鐵俠交出了自己的指揮權，所有的地球超級英雄團結在伊米爾的身邊，救出了在紐約陷入苦戰的超級英雄們，在那，斯庫魯人和征服者康，幾乎已經確立了統治地位。