真金又征召潞州的楊仁風、東平的馬紹，任楊恭懿到中書省議事，命衛輝總管董文用練達官政，與楊恭懿同調入中書省中。在真金的大力支持下，和禮霍孫主要完成了幾項重大任務：一、查處阿合馬的罪行，籍沒阿合馬家財；二、起用舊臣；三、改善吏治。然而真金實際並無左右朝政的權力，大權始終掌握在精明專斷的其父忽必烈手中。

    真金不斷推動漢化政策，要求蒙古國子生學習漢文，對隻學蒙古文不以為然。他通過和禮霍孫上奏請開設科舉，不過沒有成功。忽必烈仍對理財派念念不忘，任用漢族商人盧世榮理財，同時新任正宮南必皇後頗有幹政的跡象，這又為真金與漢臣所不滿。真金指斥盧世榮說道：“錢財不是從天上掉下來的，怎能每年榨取贏利呢？我隻怕老百姓的膏血因此枯竭，不止是害民而已，實在是國家的大蛀蟲啊！”盧世榮被起用數月後，被真金領導的漢法派彈劾下台並下獄處死，理財派要人桑哥雖然袒護盧世榮，卻因害怕真金而不敢相救。

    至元二十二年春，有一名南台禦史上疏請年事已高的忽必烈禪位於皇太子，並請南必皇後不要再幹政。真金得知此事後，甚為恐懼，當時禦史台中的漢人禦史全部空缺，擔任都事的尚文偷偷地把這份奏章隱匿下來。然而此事已被阿合馬餘部答即古阿散等得知，於是老師在忽必烈麵前請收內外百司吏案，名為大索天下埋沒錢糧，實為揭露此奏章。忽必烈於是悉拘封禦史台吏案，謀取這份奏章。尚文深知關係重大，右丞相安童、禦史大夫玉昔帖木兒拒不付予。古阿散告訴了忽必烈，忽必烈大怒，命令大宗正薛尺索取該奏章。

    真金憂懼不知所措，安童和玉昔帖木兒也束手無策。尚文從阿合馬舊案中搜集到答即古阿散黨羽的數十條罪狀，便請玉昔帖木兒親往中書省與安童商量對策。尚文獻計說：皇太子為天下本，如果奏章被揭發出來，將傾覆太子，動搖國本，禍不可言，隻有先發製人，變被告為原告。安童和玉昔帖木兒搶先以答即古阿散的罪狀入奏，陳述事情經過。

    忽必烈聽到有人要他退位，果然怒不可遏，厲聲責問道：“你們沒罪嗎？”丞相安童帶頭認罪道：“臣等不會逃避罪行，但答即古阿散等人的罪名是在刑律上寫的清清楚楚的，他們又不是什好東西，如果貿然動他們必定會危害生靈，所以應該選重臣作為這個案子的主管，差不多能平息紛擾。”忽必烈怒氣稍解，形勢遂趨緩和。後來答即古阿散等阿合馬餘黨被判奸贓罪而處死，真金因此而憂懼成疾，於同年十二月十日病死，享年四十三歲。真金死後，忽必烈於次年正月初一停止朝賀，為其上諡號為“明孝”。

    忽必烈悲悼未已，忽然西北一帶，警報迭傳，有同族相殘的禍案，釀成分裂。原來成吉思汗即大汗位，到忽必烈統一中原，先後不過七十年，除亞洲南部之外，全洲都被元朝占領。就是歐洲東北一部分，也被占領，元朝成了一個大帝國。當時蒙古諸王族，各有分土，共有四國。

    一是伊兒汗國，二是欽察汗國，三是察合台汗國，四是窩闊台汗國。這四個汗國就封後，一切內政，由他自理，名義上還是歸由忽必烈統領。忽必烈於是建阿母河行省，監製伊兒、欽察兩汗國；置嶺北行省，監製窩闊台汗國；設阿力麻及別失八兩元帥府，監製察合台汗國。還有一班皇族宗親，立遼陽行省，作為監督。總以為能內外相輔、上下相製，成就帝王萬世的基業。

    窩闊台汗國從蒙哥繼位後，就心懷不平。到了忽必烈繼位，太宗孫海都為窩闊台汗國。阿不哥敗亡之後，海都汗靜蓄兵力，心存異誌。這時察合台已經死去，他的孫子亞兒古為察合台汗，就和海都結盟。忽必烈探知底細，派遣使者到察合台汗國，廢黜了亞兒古，另立察合台族曾孫八剌為汗。

    忽必烈命連結欽察汗國，與拔都的孫子蒙哥帖木兒彼此相倚，共同壓製海都。誰知八剌不懷好意，反而唆使海都，想圖謀欽察汗國。海都引兵進入欽察國，蒙哥帖木兒早已得知，暗中出兵襲擊海都的後麵。海都回軍抵敵，八剌又背叛了海都，將海都所侵的土地，全部占據。

    海都怒不可遏，急忙向欽察汗求和，因此得到了欽察的援兵，殺退了八剌。八剌很是狡猾，寫書信給海都，說要向燕都請求援兵，和他拚命。海都正怕這點，不得已與他講和。因此三汗勾結起來，同會於怛羅斯河畔，推海都為蒙古大汗。

    海都傳檄伊兒汗國，令他一同推戴，共抗燕都。伊兒汗國的始祖是旭烈兀，是忽必烈的親弟弟，向來服從忽必烈。旭烈兀死後，他的兒子阿八哈繼承父琴遺誌，不肯附和海都。海都於是和八剌合兵攻入伊兒汗國的國境，還約欽察汗蒙哥帖木兒，侵略伊兒汗國西北。阿八哈頗有父風，熟嫻兵事，當即調集部眾，迎戰海都、八剌的聯合軍。兩軍相遇，阿八哈略戰即退，誘敵深入險地，用四麵埋伏計，衝破敵兵。海都、八剌幾乎被擒，幸虧逃走得快，才得以保命。